Das historische Rathaus wurde erstmals 1407 als Sitz des Andernachers Rates erwähnt, mit jüdischer Mikwe, einem Ritualbad, aus dem 13. Jahrhundert der damaligen Synagoge, die über drei unterirdische Stockwerke mit dem Rhein verbunden war. Die Ersterrichtung des heutigen Baus fing 1561 an und endete 1574 mit ursprünglich offener, kreuzgewölbten Markthalle im Parterre zur Hochstraße. Viele namhafte Künstler beteiligten sich an der Errichtung.
1689 nach der Brandnacht der Fanzosen wurde das historische Rathaus erst 100 Jahre später wieder aufgebaut. Der neue Bau wurde im Stil der Barockzeit mit Lisenen, Zwerchhaus und Mansarddach errichtet. Durch einen Holzgang ist es mit dem sogenannten Salzhaus, dem Ratssaal, verbunden.
Heute beherbergt das historische Rathaus die Stadtbücherei und unter dem Sitzungssaal befindet sich immer noch die mittelalterliche Mikwe, dem jüdischen Kultbad.